高速基因分析系统——第二代DNA测序仪（水生所）

仪器的基本信息

仪器名称：高速基因分析系统——第二代DNA测序仪

英文名称：Genome Analyzer

型号：Illumina Genome Analyzer II x(GAIIx)

制造商：Illumina 公司

产地：美国

购买年份：2010年

存放地点：分析测试中心416（中科院水生所新实验大楼）

管理人员：乔志仙

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仪器的用途

未知物种全基因组测序，已知物种再测序，全基因表达组定量分析，全基因组小RNA分析，染色质免疫互沉淀（ChIP）研究，甲基化研究，转录组分析。

仪器的性能指标

高数据通量：每次反应可生成大于500亿碱基数据

每次运行至少可生成可读138M个片段标签序列

运行成本：从样品制备到数据读取，每测量1000个碱基对所需成本不高于0.0009美元

数据读长：单端读取序列，读长不低于100个碱基；

双端读取序列：读长不低于2x100个碱基

样品用量：DNA样本需要0.1-1ug

读取精度：原始数据准确性≥98％，3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%

可精确读取≥10个的连续单个重复碱基（如AAAAAAAAAA），准确性≥99%(50bp)

不同样品并行性：每次仪器运行可平行分析≥8个非混合的独立样品

样品制备可在一天内完成，自动化过程，电脑软件控制

测序结果以实时碱基形式显示，方便数据的比对和分析